2006年，深圳港集装箱吞吐量在连年稳定增长的基础上，再创佳绩，全年完成集装箱吞吐量1846.89万标箱，增长14.03%。全年深圳港货物吞吐量达17584.02万吨，增长14.56%，其中外贸货物吞吐量12685.88万吨，增长19.25％；进出港船舶26.11万艘次，增长3.05％。深圳港已连续4年稳居世界第4大集装箱港口。

专家分析，深圳港总体货量的稳步增长，主要受益于我国对外贸易的不断发展。特别是占全国外贸市场份额1／3的珠三角地区经济快速增长，为深圳港提供了充足的货源，无论是集装箱还是大宗散杂货及油气品，均取得了骄人的业绩。